Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English | Polski

Prolib Integro - strona głównaBiblioteka WSB we Wrocławiu

Przeglądasz jako GOŚĆ
Zmień bibliotekę

Wyszukujesz frazę ""Darrin M. York"" wg kryterium: Autor

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-20 z 179
Podgląd okładki
Tytuł :
Fast, Accurate, and Reliable Protocols for Routine Calculations of Protein–Ligand Binding Affinities in Drug Design Projects Using AMBER GPU-TI with ff14SB/GAFF
Autorzy :
Xibing He
Shuhan Liu
Tai-Sung Lee
Beihong Ji
Viet H. Man
Darrin M. York
Junmei Wang
Pokaż więcej
Temat :
Chemistry
QD1-999
Źródło :
ACS Omega, Vol 5, Iss 9, Pp 4611-4619 (2020)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://doaj.org/toc/2470-1343
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/42dd42a02312406ab6a8c559b3704956
Czasopismo naukowe
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
A Comparison of QM/MM Simulations with and without the Drude Oscillator Model Based on Hydration Free Energies of Simple Solutes
Autorzy :
Gerhard König
Frank C. Pickard
Jing Huang
Walter Thiel
Alexander D. MacKerell
Bernard R. Brooks
Darrin M. York
Pokaż więcej
Temat :
hydration free energy
QM/MM
polarization
Organic chemistry
QD241-441
Źródło :
Molecules, Vol 23, Iss 10, p 2695 (2018)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
http://www.mdpi.com/1420-3049/23/10/2695; https://doaj.org/toc/1420-3049
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/9b68bce499fa4e81ae79e019fa7108f5
Czasopismo naukowe
Szczegóły Pełny tekst Pełny tekst
Podgląd okładki
Tytuł :
CHARMM-GUI Free Energy Calculator for Practical Ligand Binding Free Energy Simulations with AMBER
Autorzy :
Han Zhang
Seonghoon Kim
Timothy J. Giese
Tai-Sung Lee
Jumin Lee
Darrin M. York
Wonpil Im
Pokaż więcej
Temat :
Library and Information Sciences
Computer Science Applications
General Chemical Engineering
General Chemistry
Article
Źródło :
J Chem Inf Model
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::eeaf0df4a9b353193aec07df71d03375
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jcim.1c00747
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Peripheral Methionine Residues Impact Flavin Photoreduction and Protonation in an Engineered LOV Domain Light Sensor
Autorzy :
Estella F. Yee
Sabine Oldemeyer
Elena Böhm
Abir Ganguly
Darrin M. York
Tilman Kottke
Brian R. Crane
Pokaż więcej
Temat :
Biochemistry
Źródło :
Biochemistry. 60:1148-1164
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::06757b02355f9bdcaaf5b2d5c5d57690
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.biochem.1c00064
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Extension of the Variational Free Energy Profile and Multistate Bennett Acceptance Ratio Methods for High-Dimensional Potential of Mean Force Profile Analysis
Autorzy :
Timothy J. Giese
Şölen Ekesan
Darrin M. York
Pokaż więcej
Temat :
Physical and Theoretical Chemistry
Źródło :
The Journal of Physical Chemistry A. 125:4216-4232
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::8c7a03bdeb8cff6ad5f4a32a2d6eea1b
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jpca.1c00736
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Variational Method for Networkwide Analysis of Relative Ligand Binding Free Energies with Loop Closure and Experimental Constraints
Autorzy :
Darrin M. York
Timothy J. Giese
Pokaż więcej
Temat :
Physical and Theoretical Chemistry
Computer Science Applications
Bootstrapping (electronics)
Applied mathematics
Generalized coordinates
Bennett acceptance ratio
Computer science
Minification
Variational method
Affine transformation
Thermodynamic cycle
Nonlinear programming
Źródło :
Journal of Chemical Theory and Computation. 17:1326-1336
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::5fe5c0e55e312e5074df4d63e041baa2
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jctc.0c01219
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Beneath the Surface: An Investigation of General Chemistry Students’ Study Skills to Predict Course Outcomes
Autorzy :
Darrin M. York
Emily L. Atieh
Marc N. Muniz
Pokaż więcej
Temat :
Education
General Chemistry
Attrition
medicine.disease
medicine
Learning theory
Higher education
business.industry
business
Psychology
Mathematics education
Study skills
Conversation
media_common.quotation_subject
media_common
Źródło :
Journal of Chemical Education. 98:281-292
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::71562d156f16ab1f4758f13677d0a00c
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jchemed.0c01074
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Robust, Efficient and Automated Methods for Accurate Prediction of Protein-Ligand Binding Affinities in AMBER Drug Discovery Boost
Autorzy :
Tai-Sung Lee
Hsu-Chun Tsai
Abir Ganguly
Timothy J Giese
Darrin M. York
Pokaż więcej
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::528b8ef182481df03b928a2ed290e1ff
https://chemrxiv.org/engage/api-gateway/chemrxiv/assets/orp/resource/item/60c73cc94c891981e9ad1af3/original/robust-efficient-and-automated-methods-for-accurate-prediction-of-protein-ligand-binding-affinities-in-amber-drug-discovery-boost.pdf
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Alchemical Binding Free Energy Calculations in AMBER20: Advances and Best Practices for Drug Discovery
Autorzy :
David A. Pearlman
Brian K. Radak
Darrin M. York
Tai-Sung Lee
Bryce K. Allen
Pengfei Li
Timothy J. Giese
Hsu Chun Tsai
Woody Sherman
Huafeng Xu
Charles Lin
Yujun Tao
T. Dwight McGee
Zhenyu Guo
Pokaż więcej
Temat :
Library and Information Sciences
Computer Science Applications
General Chemical Engineering
General Chemistry
Computational chemistry
Binding affinities
Binding free energy
Chemistry
Drug discovery
Article
Źródło :
J Chem Inf Model
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::fdc7898b89dd74b693b2fdfec12e629a
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jcim.0c00613
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Through the Looking CLASS: When Peer Leader Learning Attitudes Are Not What They Seem
Autorzy :
Darrin M. York
Emily L. Atieh
Pokaż więcej
Temat :
Education
General Chemistry
Medical education
Psychology
Role model
Population
education.field_of_study
education
Peer leadership
Survey result
Constructivism (philosophy of education)
Internship
Peer instruction
Survey data collection
Article
ComputingMilieux_COMPUTERSANDEDUCATION
Źródło :
J Chem Educ
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::6266c4eeb291c5810d01c296024bc30e
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jchemed.0c00129
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Improved Alchemical Free Energy Calculations with Optimized Smoothstep Softcore Potentials
Autorzy :
Darrin M. York
Bryce K. Allen
Hsu Chun Tsai
Charles Lin
Yujun Tao
Woody Sherman
Tai-Sung Lee
Brian K. Radak
Zhixiong Lin
Pokaż więcej
Temat :
Physical and Theoretical Chemistry
Computer Science Applications
Applied mathematics
Monomial
Energy simulation
Numerical stability
Polynomial
Computer science
Convergence (routing)
Smoothing
Smoothstep
Software
business.industry
business
Article
Źródło :
J Chem Theory Comput
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::6a0556ac95521067a4c1170e93211965
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jctc.0c00237
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Fast, Accurate, and Reliable Protocols for Routine Calculations of Protein–Ligand Binding Affinities in Drug Design Projects Using AMBER GPU-TI with ff14SB/GAFF
Autorzy :
Junmei Wang
Beihong Ji
Shuhan Liu
Xibing He
Viet Hoang Man
Tai-Sung Lee
Darrin M. York
Pokaż więcej
Temat :
General Chemical Engineering
General Chemistry
Computer science
Free energies
Software package
Binding affinities
Thermodynamic integration
Experimental work
Computational science
Protein ligand
Central processing unit
Computation
Article
Źródło :
ACS Omega
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::3a9925d0c40e637ee77fe593e3d33b4b
http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acsomega.9b04233
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Validation of Free Energy Methods in AMBER
Autorzy :
Yujun Tao
Kenneth M. Merz
Tai-Sung Lee
Hsu-Chun Tsai
Darrin M. York
Pokaż więcej
Temat :
Article
Library and Information Sciences
Computer Science Applications
General Chemical Engineering
General Chemistry
Bar (unit)
Gas phase
Materials science
Computational physics
Energy method
Źródło :
J Chem Inf Model
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::fe87be73a7045c6a899ac03aa33515ed
https://europepmc.org/articles/PMC7686255/
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Free Energy Methods in Drug Discovery: Current State and Future Directions
Autorzy :
Kira A. Armacost
David C. Thompson
Zoe Cournia
Christophe Chipot
Benoît Roux
Darrin M. York
Woody Sherman
Katharina Meier
Joseph P. Bluck
Clara D. Christ
Nicolas Tielker
Lukas Eberlein
Oliver Beckstein
Stefan Güssregen
Bogdan I. Iorga
Stefan M. Kast
Shuai Liu
Miroslav Suruzhon
Marley L. Samways
Jonathan W. Essex
Ayşegül Özen
Emanuele Perola
Natasja Brooijmans
Joseph Kim
Dilek Coskun
Tai-Sung Lee
Hsu-Chun Tsai
Abir Ganguly
Timothy J. Giese
Jennifer L. Knight
Karl Leswing
Pieter H. Bos
Lingle Wang
Paul Labute
Maximilian Ebert
Lance M. Westerhoff
Zheng Zheng
Eric C. Gladstone
Pokaż więcej
Temat :
Thermodynamic potentials
Drugs--Design
Drug development
Typ zasobu :
eBook.
Kategorie :
SCIENCE / Chemistry / Computational & Molecular Modeling
SCIENCE / Energy
Książka elektroniczna
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Toward Fast and Accurate Binding Affinity Prediction with pmemdGTI: An Efficient Implementation of GPU-Accelerated Thermodynamic Integration
Autorzy :
Zhuyan Guo
Tai-Sung Lee
Yuan Hu
Darrin M. York
Bradley Sherborne
Pokaż więcej
Temat :
Physical and Theoretical Chemistry
Computer Science Applications
Computer science
Thermodynamic integration
Binding affinities
Multi-core processor
Orders of magnitude (numbers)
Ligand (biochemistry)
Parallel computing
Drug discovery
Article
Źródło :
Journal of Chemical Theory and Computation. 13:3077-3084
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::d6cbaa73bd34429dbedad29957a13144
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jctc.7b00102
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Divalent Metal Ion Activation of a Guanine General Base in the Hammerhead Ribozyme: Insights from Molecular Simulations
Autorzy :
Haoyuan Chen
Barbara L. Golden
Darrin M. York
Timothy J. Giese
Pokaż więcej
Temat :
Biochemistry
Hammerhead ribozyme
biology.organism_classification
biology
Molecular dynamics
Guanine
chemistry.chemical_compound
chemistry
Nucleophile
Ribozyme
biology.protein
Phosphodiester bond
Stereochemistry
RNA
Nucleobase
Źródło :
Biochemistry. 56:2985-2994
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::dcf90d90ea7198463262948435bc2631
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.biochem.6b01192
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Validation of AMBER/GAFF for Relative Free Energy Calculations
Autorzy :
Chun-Zhu
Kenneth M. Merz
Tai-Sung Lee
Lin Frank Song
Darrin M. York
Pokaż więcej
Temat :
Physics
Thermodynamics
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::3a24b8f275dc221fc80a945f824ccc82
https://chemrxiv.org/engage/api-gateway/chemrxiv/assets/orp/resource/item/60c7402a0f50dbbb9b3958ff/original/validation-of-amber-gaff-for-relative-free-energy-calculations.pdf
Szczegóły
Wyświetlanie 1-20 z 179

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies