Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English | Polski

Prolib Integro - strona głównaBiblioteka WSB we Wrocławiu

Przeglądasz jako GOŚĆ
Zmień bibliotekę

Wyszukujesz frazę ""Woody Sherman"" wg kryterium: Autor

  Lista filtrów
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-20 z 74
Podgląd okładki
Tytuł :
Physics-based modeling provides predictive understanding of selectively promiscuous substrate binding by Hsp70 chaperones.
Autorzy :
Erik B Nordquist
Charles A English
Eugenia M Clerico
Woody Sherman
Lila M Gierasch
Jianhan Chen
Pokaż więcej
Temat :
Biology (General)
QH301-705.5
Źródło :
PLoS Computational Biology, Vol 17, Iss 11, p e1009567 (2021)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://doaj.org/toc/1553-734X; https://doaj.org/toc/1553-7358
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/c7c62c52138f41678ab83327c4c6abb7
Czasopismo naukowe
Szczegóły Pełny tekst Pełny tekst
Podgląd okładki
Tytuł :
Predicting Binding Affinities for GPCR Ligands Using Free-Energy Perturbation
Autorzy :
Eelke B. Lenselink
Julien Louvel
Anna F. Forti
Jacobus P. D. van Veldhoven
Henk de Vries
Thea Mulder-Krieger
Fiona M. McRobb
Ana Negri
Joseph Goose
Robert Abel
Herman W. T. van Vlijmen
Lingle Wang
Edward Harder
Woody Sherman
Adriaan P. IJzerman
Thijs Beuming
Pokaż więcej
Temat :
Chemistry
QD1-999
Źródło :
ACS Omega, Vol 1, Iss 2, Pp 293-304 (2016)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://doaj.org/toc/2470-1343
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/5d70f3f686804fd6b931cfc4929e3914
Czasopismo naukowe
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Applying physics-based scoring to calculate free energies of binding for single amino acid mutations in protein-protein complexes.
Autorzy :
Hege Beard
Anuradha Cholleti
David Pearlman
Woody Sherman
Kathryn A Loving
Pokaż więcej
Temat :
Medicine
Science
Źródło :
PLoS ONE, Vol 8, Iss 12, p e82849 (2013)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/pmid/24340062/?tool=EBI; https://doaj.org/toc/1932-6203
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/d236eef087cb446ba55c7e0112ce530e
Czasopismo naukowe
Szczegóły Pełny tekst
Podgląd okładki
Tytuł :
Atomic-Resolution Prediction of Degrader-mediated Ternary Complex Structures by Combining Molecular Simulations with Hydrogen Deuterium Exchange
Autorzy :
Tom Dixon
Derek MacPherson
Barmak Mostofian
Taras Dauzhenka
Samuel Lotz
Dwight McGee
Sharon Shechter
Utsab R. Shrestha
Rafal Wiewiora
Zachary A. McDargh
Fen Pei
Rajat Pal
João V. Ribeiro
Tanner Wilkerson
Vipin Sachdeva
Ning Gao
Shourya Jain
Samuel Sparks
Yunxing Li
Alexander Vinitsky
Asghar M. Razavi
István Kolossváry
Jason Imbriglio
Artem Evdokimov
Louise Bergeron
Alex Dickson
Huafeng Xu
Woody Sherman
Jesus A. Izaguirre
Pokaż więcej
Źródło :
Crossref
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::aab72e51a2dd74a1d61536d796a4ff20
https://syndication.highwire.org/content/doi/10.1101/2021.09.26.461830
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Fast Equilibration of Water between Buried Sites and Bulk by MD with Parallel Monte Carlo Water Moves on GPUs
Autorzy :
Ido Ben-Shalom
Charles Lin
Brian Radak
Woody Sherman
Michael Gilson
Pokaż więcej
Źródło :
Crossref
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::c7d5ec23765e223ed1e3dffd2b6855d2
https://chemrxiv.org/engage/api-gateway/chemrxiv/assets/orp/resource/item/6123cb101d1cc2684fcab40a/original/fast-equilibration-of-water-between-buried-sites-and-bulk-by-md-with-parallel-monte-carlo-water-moves-on-gp-us.pdf
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Alchemical Binding Free Energy Calculations in AMBER20: Advances and Best Practices for Drug Discovery
Autorzy :
David A. Pearlman
Brian K. Radak
Darrin M. York
Tai-Sung Lee
Bryce K. Allen
Pengfei Li
Timothy J. Giese
Hsu Chun Tsai
Woody Sherman
Huafeng Xu
Charles Lin
Yujun Tao
T. Dwight McGee
Zhenyu Guo
Pokaż więcej
Temat :
Library and Information Sciences
Computer Science Applications
General Chemical Engineering
General Chemistry
Computational chemistry
Binding affinities
Binding free energy
Chemistry
Drug discovery
Article
Źródło :
Crossref
J Chem Inf Model
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::fdc7898b89dd74b693b2fdfec12e629a
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jcim.0c00613
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Improved Alchemical Free Energy Calculations with Optimized Smoothstep Softcore Potentials
Autorzy :
Darrin M. York
Bryce K. Allen
Hsu Chun Tsai
Charles Lin
Yujun Tao
Woody Sherman
Tai-Sung Lee
Brian K. Radak
Zhixiong Lin
Pokaż więcej
Temat :
Physical and Theoretical Chemistry
Computer Science Applications
Applied mathematics
Monomial
Energy simulation
Numerical stability
Polynomial
Computer science
Convergence (routing)
Smoothing
Smoothstep
Software
business.industry
business
Article
Źródło :
Crossref
J Chem Theory Comput
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::6a0556ac95521067a4c1170e93211965
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jctc.0c00237
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Rigorous Free Energy Simulations in Virtual Screening
Autorzy :
Thijs Beuming
Brian K. Radak
David A. Pearlman
Woody Sherman
Bryce K. Allen
Zoe Cournia
Pokaż więcej
Temat :
Library and Information Sciences
Computer Science Applications
General Chemical Engineering
General Chemistry
Experimental testing
Drug discovery
Computer science
Binding free energy
Biochemical engineering
Virtual screening
Workflow
Źródło :
Crossref
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::651790d3911dbb9ac7adebd7663cd20f
http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jcim.0c00116
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Mechanism of biomolecular recognition of trimethyllysine by the fluorinated aromatic cage of KDM5A PHD3 finger
Autorzy :
Maud H. M. Wuts
Thijs Beuming
Ger J. M. Pruijn
Jos J. A. G. Kamps
Jasmin Mecinović
Paul B. White
Jordi Poater
F. Matthias Bickelhaupt
Robert S. Paton
Kiran Kumar
Woody Sherman
Bas J. G. E. Pieters
Pokaż więcej
Temat :
lcsh:Chemistry
lcsh:QD1-999
Materials Chemistry
Biochemistry
Environmental Chemistry
General Chemistry
Molecule
Histone
biology.protein
biology
KDM5A
Stereochemistry
Bound water
Histone code
Chemistry
Epigenetics
Lysine
Tryptophan
Chemistry(all)
Źródło :
Communications Chemistry, Vol 3, Iss 1, Pp 1-12 (2020)
Crossref
Communications Chemistry, 3
Communications Chemistry
Pieters, B J G E, Wuts, M H M, Poater, J, Kumar, K, White, P B, Kamps, J J A G, Sherman, W, Pruijn, G J M, Paton, R S, Beuming, T, Bickelhaupt, F M & Mecinović, J 2020, ' Mechanism of biomolecular recognition of trimethyllysine by the fluorinated aromatic cage of KDM5A PHD3 finger ', Communications Chemistry, vol. 3, 69 . https://doi.org/10.1038/s42004-020-0313-2
Communications Chemistry, 3(1):69, 1-12. Springer Nature
Opis pliku :
application/pdf
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::10178b367b5719086ad0d3aa769b5e24
http://link.springer.com/article/10.1038/s42004-020-0313-2
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
A Communication-Efficient Multi-Chip Design for Range-Limited Molecular Dynamics
Autorzy :
Chen Yang
Woody Sherman
Martin C. Herbordt
Chunshu Wu
Vipin Sachdeva
Tong Geng
Pokaż więcej
Temat :
Bandwidth cap
Computation
Computer science
Integrated circuit design
Bandwidth (signal processing)
Distributed computing
Locality
Transceiver
Field-programmable gate array
Workload
Źródło :
Crossref
HPEC
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::c51fcf3ecae15831dd59bcfc097d97da
http://xplorestaging.ieee.org/ielx7/9285977/9286137/09286146.pdf?arnumber=9286146
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Accounting for the Central Role of Interfacial Water in Protein-Ligand Binding Free Energy Calculations
Autorzy :
Michael K. Gilson
Ido Y. Ben-Shalom
Zhixiong Lin
Charles Lin
Brian K. Radak
Woody Sherman
Pokaż więcej
Temat :
Computer Aided Drug Design
Molecular Dynamics
Monte Carlo
Relative Binding Free Energy
Buried Water
AMBER
Physical and Theoretical Chemistry
Computer Science Applications
Hysteresis
Ligand
Protein ligand
Molecular dynamics
Materials science
Boltzmann distribution
Hybrid Monte Carlo
Binding site
Chemical physics
Molecule
Źródło :
Crossref
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::cb305fb3eae753f26847892b6156f242
https://chemrxiv.org/engage/api-gateway/chemrxiv/assets/orp/resource/item/60c74de3842e65d570db3533/original/accounting-for-the-central-role-of-interfacial-water-in-protein-ligand-binding-free-energy-calculations.pdf
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Abstract LB-A20: True small molecule STING agonist generates systemic and potent anti-tumor immunity required for effective cancer immunotherapy
Autorzy :
Steven Swann
Bryce K. Allen
Sharon Shechter
Woody Sherman
Dazhi Tan
James M. Rice
Cecilia Bastos
Sam Sparks
Stella Li
Ramya Samant
Mohammed Taimi
Holly Soutter
Meghana M. Kulkarni
Bethany Tesar
Cheryl Koh
Christopher Winter
Zhixiong Lin
Chamberlain Brian T
Dwight Timothy A
Marino Kristen A
Sujen Lai
Huang Huang
Pokaż więcej
Temat :
Immune system
Cancer immunotherapy
medicine.medical_treatment
medicine
Sting
Cancer research
Stimulator of interferon genes
Innate immune system
T cell
medicine.anatomical_structure
IRF3
Tumor microenvironment
Źródło :
Crossref
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::3436981b15293fda76f7de8c89981960
https://syndication.highwire.org/content/doi/10.1158/1535-7163.TARG-19-LB-A20
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Fully integrated FPGA molecular dynamics simulations
Autorzy :
Rushi Patel
Tianqi Wang
Chen Yang
Woody Sherman
Charles Lin
Tong Geng
Chunshu Wu
Martin C. Herbordt
Vipin Sachdeva
Jiayi Sheng
Ahmed Sanaullah
Qingqing Xiong
Pokaż więcej
Temat :
Potential impact
Whole systems
Computer science
Parallel computing
Field-programmable gate array
Computer data storage
business.industry
business
Industrial production
Implementation
Molecular dynamics
Supercomputer
Źródło :
Crossref
SC
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::2dcd13f0e70cb3ee5f94663e26b5c22d
https://dl.acm.org/doi/pdf/10.1145/3295500.3356179
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Molecular Dynamics Range-Limited Force Evaluation Optimized for FPGAs
Autorzy :
Vipin Sachdeva
Jiayi Sheng
Charles Lin
Tianqi Wang
Tong Geng
Martin C. Herbordt
Chen Yang
Woody Sherman
Pokaż więcej
Temat :
Input/output
Supercomputer
FLOPS
Computational science
Data exchange
Computer science
Field-programmable gate array
Data migration
Throughput
Floating point
Źródło :
Crossref
ASAP
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::06278c529474cc4ec9726eecbbd6feec
http://xplorestaging.ieee.org/ielx7/8812310/8824995/08825132.pdf?arnumber=8825132
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Deciphering Cryptic Binding Sites on Proteins by Mixed-Solvent Molecular Dynamics
Autorzy :
Angelo D. Favia
Woody Sherman
Hai Peng Hu
Anatoly M. Ruvinsky
S. Roy Kimura
Pokaż więcej
Temat :
Library and Information Sciences
Computer Science Applications
General Chemical Engineering
General Chemistry
Binding site
Protein folding
Druggability
Protein structure
Ligand (biochemistry)
Chemistry
Stereochemistry
Molecular dynamics
Allosteric regulation
Protein Data Bank (RCSB PDB)
Źródło :
Crossref
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::fe538bd884beea97116e2103e3af70d3
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jcim.6b00623
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Free Energy Methods in Drug Discovery: Current State and Future Directions
Autorzy :
Kira A. Armacost
David C. Thompson
Zoe Cournia
Christophe Chipot
Benoît Roux
Darrin M. York
Woody Sherman
Katharina Meier
Joseph P. Bluck
Clara D. Christ
Nicolas Tielker
Lukas Eberlein
Oliver Beckstein
Stefan Güssregen
Bogdan I. Iorga
Stefan M. Kast
Shuai Liu
Miroslav Suruzhon
Marley L. Samways
Jonathan W. Essex
Ayşegül Özen
Emanuele Perola
Natasja Brooijmans
Joseph Kim
Dilek Coskun
Tai-Sung Lee
Hsu-Chun Tsai
Abir Ganguly
Timothy J. Giese
Jennifer L. Knight
Karl Leswing
Pieter H. Bos
Lingle Wang
Paul Labute
Maximilian Ebert
Lance M. Westerhoff
Zheng Zheng
Eric C. Gladstone
Pokaż więcej
Temat :
Thermodynamic potentials
Drugs--Design
Drug development
Typ zasobu :
eBook.
Kategorie :
SCIENCE / Chemistry / Computational & Molecular Modeling
SCIENCE / Energy
Książka elektroniczna
Szczegóły
Podgląd okładki
Tytuł :
Predicting the Effect of Amino Acid Single-Point Mutations on Protein Stability—Large-Scale Validation of MD-Based Relative Free Energy Calculations
Autorzy :
Jianxin Duan
Thomas Steinbrecher
David A. Pearlman
Woody Sherman
Chongkai Zhu
Lingle Wang
Eric Feyfant
Christopher Negron
Robert Abel
Pokaż więcej
Temat :
Molecular Biology
Structural Biology
Computational chemistry
Free energy perturbation
Small molecule
Biological system
Statistical potential
Thermodynamic equilibrium
Molecular dynamics
Structural biology
Protein folding
Chemistry
Protein engineering
Źródło :
Crossref
Dostępność :
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::b996cd129f406d5b08c319836d85c1e8
https://api.elsevier.com/content/article/PII:S0022283616305368?httpAccept=text/xml
Szczegóły
Wyświetlanie 1-20 z 74

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies